Pour compléter ce que dit Guylow.

Traitement des cavités
(D’après William MOORE – cours de biologie approfondie- stage « voyage au cœur de l’arbre » – Atelier de l’Arbre)
La chirurgie des arbres est pratiquée depuis longtemps dans le monde entier. Il s’agit du curage des foyers de pourriture avec des rabots et des ciseaux. Le bois pourri et le bois coloré sont enlevés jusqu’au « bois sain ». Ensuite la plaie est badigeonnée de mastics dans le but de la « protéger » des agents pathogènes.
Les arbres traités de cette manière se dégradent très rapidement après le traitement. Les parois de protection (notamment la zone de barrage) étant détruites, les agents pathogènes progressent facilement dans le bois sain présent au moment de la blessure protégé par la zone de réaction (paroi 1, 2 et 3) et dans le bois sain formé après la blessure qui était protégé jusqu’à présent par la zone de barrage (paroi IV). De plus le mastic va créer des conditions de confinement propices à leur développement.
Le Drainage des cavités est tout aussi néfaste pour l’arbre. En effet, la pose de drains implique le percement de la zone de barrage (paroi IV) et des zones de réaction. Les champignons alors compartimentés par l’arbre dans les zones de défense dans le bois présent au moment de la blessure trouvent une voie royale de propagation dans le bois néoformé qui était sain.
La présence d’eau dans une cavité ne doit pas être considérée comme un facteur néfaste à la santé de l’arbre car ce sont les agents pathogènes qui causent la dégradation du bois et non pas l’eau. En fait la présence d’eau rend le milieu anaérobie (absence d’oxygène libre) uniquement favorable aux bactéries qui ont un pouvoir dégradant très faible et très lent donc permettant à l’arbre une réaction efficace. Par contre les agents pathogènes les plus agressifs aux pouvoirs dégradant très rapide ne tolèrent pas ces conditions.
Drainer l’eau des cavités permet de rendre favorable au développement des champignons, un site qui ne l’était pas auparavant, ce milieu devenant aérobie.


Source : http://lestetardsarboricoles.fr/wordpre … ricole.pdf

...percer serait une erreur...une cavite remplie d'eau forme un milieu en anaerobie, protegeant ainsi l'arbre contre certaines agressions.